В то время как отцовская линия почетного короля Хуана Карлоса хорошо известна и ведет свое начало от королевы Изабеллы II, его родословная по материнской линии не менее богата и разнообразна. Она связывает испанскую монархию с королевскими домами Бразилии, Португалии и бывшей Чехословакии, а также с аристократическими родами Польши, создавая сложную паутину европейских династических связей.
Мать Хуана Карлоса, Мария де лас Мерседес Бурбон-Сицилийская и Орлеанская (María de las Mercedes de Borbón y Orleans), была ключевой фигурой в этой истории. Ее предки принадлежали к ветви Бурбонов-Обеих Сицилий и Орлеанскому дому. Среди ее знаменитых родственников — последняя королева Португалии Амелия Орлеанская, а также графы Парижские, претендовавшие на французский престол. Кроме того, через свою мать она была связана с немецким герцогством Мекленбург. Эта ветвь также имеет прямое отношение к испанскому трону через королеву Мерседес, супругу Альфонсо XII, чья мать, Луиза Фернанда де Бурбон, была сестрой королевы Изабеллы II.
Семья матери будущего короля проводила много времени в Испании, в частности во дворце Сан-Тельмо (Palacio de San Telmo) в Севилье, который принадлежал ее прадеду и прабабушке по материнской линии, герцогам де Монпансье, а также во дворце Вильяманрике-де-ла-Кондеса (Palacio de Villamanrique de la Condesa). Сама Мария де лас Мерседес была почетной старшей сестрой известного севильского религиозного братства Макарена (Hermandad de la Macarena).
Родственники Хуана Карлоса по материнской линии, потомки инфанта Карлоса Танкредо от двух браков, образовали несколько ветвей семьи Бурбонов, которые, несмотря на браки с представителями иностранных династий, сохранили тесную связь с Испанией. Например, Альфонсо де Бурбон-Сицилийский, старший сын Карлоса Танкредо, в 1936 году женился на принцессе Алисии Бурбон-Пармской. Их средний сын, Карлос де Бурбон-Сицилийский и Бурбон-Пармский, был одним из детей, отобранных для совместного обучения с юным Хуаном Карлосом в Мадриде.
Другая ветвь семьи связана с Восточной Европой. Потомки инфанты Исабель Альфонсы переехали в Чехословакию после ее замужества. Однако после того, как ее муж, Ян Замойский, был арестован гестапо, семья была вынуждена вернуться в Испанию. У пары Замойских-Бурбонов было четверо детей, продолживших род.
Младшая сестра матери Хуана Карлоса, инфанта Эсперанса Бурбон-Сицилийская и Орлеанская, вышла замуж за принца Педру Гастана Орлеан-Браганса, правнука последнего императора Бразилии. Их дети родились в Бразилии, но всегда поддерживали тесные связи с европейскими королевскими семьями, в том числе с испанской.
