По пункту 1. За всеми этими вопросами (поддержание паспорта в актуальном состоянии и своевременности (до истечения двух лет) обновления регистрации (padron municipal) обязаны следить вы — ayuntamiento до этого нет никакого дела. А вот если вы придете на продление прописки с устаревшим паспортом, то тогда — да. Вам откажут в обновлении, предложив привести его в порядок.

На практике ayuntamiento за 3 месяца до окончания 2-годичного срока прописки присылает заинтересованному лицу письмо с напоминанием о необходимости обновления, но даже если такого и не получите — нужно до окончания этого срока обязательно обновить свою прописку. В вашем случае не видно никакой проблемы и оснований для беспокойства, или, повторяя ваши же слова «прописка действует 2 года независимо от того, когда истек паспорт».  Если, конечно же, вы не будете об этом трубить направо и налево (о недействительном паспорте) — это правило универсальное и полезное на все случаи жизни.

По пункту 2. Для обновления прописки обычно достаточно личной явки с действующим паспортом. Но нужно навести предварительно справки в своем ayuntamiento, поскольку подходы к этому могут быть разными (в зависимости от региона или даже конкретного ayuntamiento) — может потребоваться и что-то дополнительно. Я этим занимался ну ооочень давно (к тому же я был арендатором жилья — что важно само по себе) и в моем случае было так, как я и отметил.

Веласкес, Вам не обязательно дожидаться двух лет для продления прописки. Прописку можно продлить и раньше, — сейчас, пока паспорт ещё действителен. 2 года — это максимальный срок.

Если Ваше «на днях» уже наступило и паспорт просрочен, то Вы должны ПИСЬМЕННО попросить отсрочки в продлении прописки. Такая бумага в 9 случаях их 10 срабатывает, срок ожидания продлевают, ибо исполнение требований затягивается не по Вашей вине. Полезным документом в подобных ситуациях является уведомление из консульства о том, что паспорт находится на продлении. Оно временами не только служит основанием для отсрочки, но и основание для продления без наличия нового паспорта.

Большое спасибо за ответы!
Не очень понял, а какой смысл сейчас продлевать прописку по истекающему паспорту, если я ожидаю получения нового в течение пары недель (до конца 2 лет прописки)?
Мой вопрос был именно о том, не является ли истечение срока действия паспорта основанием для выписки. Как я понял, нет, поэтому лучше уже сразу продлить с новым паспортом — и заодно актуализировать его номер?

Дело в сроках.
Если у Вас срок действия паспорта истечёт раньше (на днях, это факт), чем 2 года прописки (осенью, это тоже факт), а нового паспорта ещё не будет, то продление по старому паспорту гарантирует Вам, что не-получение паспорта, как планировалось, в августе (это пока не факт) не заставит Вас волноваться. У меня была задержка с получением на 4 месяца относительно обещанного срока. Но я подстраховался: заказал получение нового «по утере» за 10 месяцев до окончания срока, таким образом не остался без паспорта ни на один день. Для меня это было важно с точки зрения поездок.

У Вас, как я понял, есть без-паспортный зазор теоретически на несколько недель, а практически… я бы на Вашем месте продлил прописку на пару месяцев раньше ещё и потому, что, например, в Торревьехе ситу на прописку трудно поймать, а потом приходится долго ждать.

Таковы мои соображения: не откладывать, чтобы иметь запас по срокам.