Здравствуйте, уважаемый Дмитрий!
К сожалению, Вы правы: сроки обжалования безвозвратно утеряны.
Данные из архива можно получить, но с точки зрения легализации проживания в Испании толк будет практически нулевой.
Об альтернативных способах легализации Вы не спрашиваете скорее всего потому, что они общеизвестны.

Спасибо за ответ!

Какую пользу можно получить от этой Резиденции ?

Например :Номер налогового плательщика  и опыт ,или что-то еще.

Если изъят дело из архива, какая практическая польза из этого может быть и как можно это применить для себя ?

Какую причину уважительную можно написать-что не смог продлить ее вовремя?

Возможно ли при новой подачи в Москве получить на 4 года сразу ,эту резиденцию ?

И какая альтернатива всего этого ?

Заранее спасибо за ответ.

По порядку следования ваших вопросов:

Какую пользу можно получить от этой Резиденции?

Например :Номер налогового плательщика и опыт ,или что-то еще.

Номер NIE – идентификационный номер иностранца – сохранится. Но точно так же он сохраняется на всю жизнь и у тех, кому NIE предоставлен против их воли, например, преступникам. Регистрационный номер физического лица – налогоплательщика если и выдадут новый, то он всё равно будет связан со старым. Вам от одного или двух номеров, по которым будет отслеживаться Ваша налоговая история, не будет ни пользы, ни потерь.

Если изъят дело из архива, какая практическая польза из этого может быть и как можно это применить для себя ?

Никакой пользу, ибо все документы, которые есть в Вашем личном деле при возобновлении иммиграционных процедур придётся получать заново, включая свидетельства о рождении, если они в деле фигурировали.

Какую причину уважительную можно написать-что не смог продлить ее вовремя?

Это совершенно лишний документ, он ни в каких новых иммиграционных процедурах не требуется. Даже не балласт, ибо избавление от блласта может принести пользу. Это будет просто “basura” – засоряющим элементом.

Возможно ли при новой подачи в Москве получить на 4 года сразу ,эту резиденцию ?

Нет. Всё будет начинаться нуля. Я понимаю, что это обидно, однако “тот поезд давно ушёл”. Бюрократический марафон по вливанию в иммигрантское сообщество придётся начинать с самого старта.

Очень слабый эффект при некоторых иммиграционных процедур могли бы дать какие-то испанские дипломы, справки о прохождении языковых курсов и т.п.

И какая альтернатива всего этого ?

Вы слишком мало сказали о своих обстоятельствах, чтобы что-то Вам предлагать.
Ваша готовность к продлению no lucrativa через консульство в Москве даём основания полагать, что Вы живёте в России, имеете гражданство этой страны и солидные накопления в Испанском банке.

Никаких иных Ваших обстоятельств Вы не назвали.
– готовность вести бизнес
– намерение учиться
– планы на создание семьи с гражданами Испании или другой страны ЕС
– стремление к научной (инвенстиционнной и т.п.) деятельности
– соответствие Ваших обстоятельств требованиям к цифровым кочевникам.